人民网海口8月5日电 （王硕）8月1日，海口市发现1例外省输入本土新冠肺炎确诊病例（轻型）。8月3日，海南医学院新冠病毒测序小组完成此次海口市发现外省输入本土新冠肺炎确诊病例（轻型）毒株测序及溯源工作，仅用20个小时即获得了高质量的测序数据，初步确认该毒株属于德尔塔（Delta）变异株。

为何核酸检测确诊后，还要做基因测序再次确认？确认毒株对海南防疫工作有哪些帮助？市民面对德尔塔病毒应该做些什么？8月4日，人民网记者采访了海南医学院新冠病毒测序小组测序团队成员。

为什么感染病例核酸检测呈阳性，还要做基因测序？

“普通的核酸检测，我们用的方法叫做荧光定量PCR，检测的时候针对这株病毒相对保守的某一段序列，但是这一段所检测的结果只能显示新冠病毒是否存在及病毒的载量，却不能够判断患者感染的是哪一亚型的新冠病毒，也无法评估它的传播能力和致病性的强弱。”测序团队成员、海南省医学院易国辉博士说。

易国辉介绍，德尔塔病毒有它特征性的突变位点，确认它是什么毒株，主要是从它区别于其他毒株的变异位点来进行比对。如果没有基因测序技术把每一个需要确认的位点解读出来的话，就没办法判定毒株到底是属于哪个株系。

“基因测序工作，实际上是将病毒的每个碱基序列都给它解读出来，那么它从头到尾长得什么样子我们都很清楚了”，易国辉说。

易国辉强调，因为测序工作中，病毒要有一定的载量，才能达到测序的条件。所以在测序之前都会先做荧光定量PCR（目前常用新冠病毒核酸检测方法）进行病毒含量的估测。“通过核酸检测结果，可以看到这个人是否携带病毒，以及携带病毒载量是高还是低，再通过基因组测序进行更深入的研究及分析，获得毒株的来源、变异情况，进而推测其传播效率和致病能力等信息。”

确认感染病例所属毒株对后续防疫工作有哪些帮助？

“我们学校党委高度重视这次测序工作，测序小组拿到病例样本后，把它与之前国内外发现毒株序列进行比对，构建分子进化树，从我们的科学数据分析上来说，可以确认该毒株属于德尔塔（Delta）变异株。”测序团队成员、海南医学院科学实验中心副主任张云霞教授说。

张云霞教授告诉记者，实验室的测序工作关系到病毒的溯源，关系到后续对疫情的研判，以及防疫工作的调整。

海南医学院生物医药资源大数据中心李永生教授进一步介绍：“每一株毒株本身都有它的结构特点，我们知道它的基因组序列以后，就可以进行比对分析，从而判断病毒的传播路径。”

据了解，李永生教授参与指导本次测序工作中数据分析。据李永生介绍，本次海口确诊病例毒株测序比对的依据主要是国际公开的数据库，而海口的这次数据也将按规定上传国家疾控数据库，为后期对其他新冠变异株的分析研究提供信息积累。

“目前国内大多数疫情的发生属于点发式，更有必要对每一个感染的个体所携带的病毒情况做密切的监控。”同样参与了数据分析工作的测序工作小组成员尹飞飞教授表示。

尹飞飞进一步解释，如果感染患者所携带的毒株在他体内发生了变异，导致它的传播力增强或者致病性增强的话，一方面，基因组测序工作可以进一步完善数据库，另外一方面，对疫情防控决策的调整和临床治疗方案的制定都具有借鉴意义。“比如说变异株的潜伏期变长了变久了，对密接者的隔离措施和时间就要调整，比如增加隔离时间，同时我们在临床治疗过程中要相应调整治疗方案。

张云霞教授介绍，实施新冠毒株基因组测序，需要具备硬件和软件两方面的准备，重要的一点是要具备相应的实验室条件。

据了解，根据国家卫生健康委员会发布的《医疗机构新型冠状病毒核酸检测工作手册（试行第二版）》，开展核酸检测的实验室，应当符合《病原微生物实验室生物安全管理条例》（国务院令第424号）和《医疗机构临床基因扩增检验实验室管理办法》（卫办医政发〔2010〕194号）的有关规定，具备经过卫生健康行政部门审核备案的生物安全二级及以上实验室条件，以及临床基因扩增检验实验室条件。

“海南医学院是海南本地目前唯一同时拥有移动生物安全三级实验室（P3实验室）和生物安全二级实验室（P2实验室）的单位，从技术力量上来说，医学院校在病原微生物的研究上，也更有优势。”张云霞教授说。

据了解，海南医学院作为海南省唯一高等医学院校，目前有较完善的学科配置及基础研究实力，也承担了海南省新发突发传染病基础研究的任务。张云霞透露，学校高度重视新发突发传染病应急响应平台的建设，在人力物力上予以大力支持，目前已经形成了一支结构合理的人才队伍，并积累了理论基础和丰富的实际操作经验。

记者了解到，根据海南省新型冠状病毒肺炎疫情防控工作指挥部要求，2020年8月，海南医学院成立新冠病毒测序小组，并建立病原快速检测平台，后续相继通过海南省新冠病毒测序及运输资质的审批，此前已多次完成了省疫情指挥部交办的新冠病毒基因组测序任务。

从专业的角度看，海南公众面对德尔塔变异毒株应该做些什么？

“从我的角度去看，我认为防护一定要非常重视，千万不能掉以轻心”，尹飞飞教授表示。

张云霞教授也提醒大家，日常应该戴好口罩勤洗手，养成良好的卫生习惯；尽量避开人群聚集场所；减少外出，尽量不出岛。同时，应该尽快接种疫苗，建立个人和社会的保护屏障。

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